Dunia diliputi oleh bahaya dan ancaman sihir. Pejuang khusus yang dikenal sebagai Inkuisitor bertugas untuk mencegah ancaman itu. Akademi Anti-Sihir adalah sekolah khusus yang didirikan untuk mendidik dan melatih para Inkuisitor. Para siswa dibagi menjadi skuad-skuad kecil untuk melatih mereka bekerja sama. Salah satunya adalah Skuad ke-35 yang dijuluki “Skuad Ikan Kecil”, kumpulan orang gagal yang mementingkan diri sendiri dan tak bisa bekerja sama. Namun, semuanya mulai berubah ketika Ouka Ootori, mantan penyelidik yang kuat bergabung.